Pada tanggal 27 Desember 2000, berdasarkan Surat Keputusan Menteri Pendidikan Nasional Republik Indonesia Nomor 237/O/2000, Jurusan Perikanan Fakultas Pertanian berubah statusnya menjadi Fakultas tersendiri dan diberi nama Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan Universitas Mulawarman (FPIK UNMUL). Gubernur Provinsi Kalimantan Timur kemudian meresmikan beroperasinya FPIK UNMUL pada tanggal 7 Februari 2001.

Pada tahun 2004, FPIK UNMUL membuka Program Konsentrasi Studi Teknologi Hasil Perikanan yang dibina di bawah Jurusan Budidaya Perairan yang menjadi awal mula berdirinya Program Studi Teknologi Hasil Perikanan. Berdasarkan Surat Keputusan Menteri Riset, Teknologi, dan Pendidikan Tinggi Republik Indonesia Nomor 138/KKPT/I/2015 Tanggal 4 Desember 2015, Program Konsentrasi Studi Teknologi Hasil Perikanan secara resmi berubah statusnya menjadi Program Studi Teknologi Hasil Perikanan di bawah Koordinasi Jurusan Budidaya Perairan Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan Universitas Mulawarman.

VISI

Menjadi Program Studi yang unggul dalam bidang pendidikan, penelitian, dan penerapan IPTEK hasil perikanan khususnya di lingkungan hutan tropis lembab tahun 2027.

MISI

1. Menyelenggarakan proses pendidikan yang berkualitas dibidang teknologi hasil perikanan untuk menghasilkan lulusan yang berdaya saing tinggi, berakhlak mulia dan berjiwa technopreneur;
2. Mengembangkan sumberdaya hayati dan produk hasil perikanan dan kelautan khususnya di lingkungan hutan tropis lembab melalui penelitian dasar dan terapan;
3. Penerapan dan penyebarluasan teknologi hasil perikanan dalam rangka mendorong percepatan pembangunan daerah dan nasional;
4. Menjalin kerjasama dibidang pendidikan, penelitian dan pengabdian masyarakat dengan pemerintah dan stakeholder.

TUJUAN

1. Menghasilkan lulusan yang berbudi luhur, mandiri, tangguh, bertanggung jawab, kreatif, dan inovatif serta berdaya saing tinggi.
2. Menghasilkan luaran penelitian melalui pengembangan teknologi pengolahan hasil perikanan khususnya di lingkungan hutan tropis lembab.
3. Mengaplikasikan teknologi hasil perikanan untuk memenuhi kebutuhan masyarakat guna mendorong percepatan pembangunan daerah dan nasional.
4. Meningkatkan kerjasama yang baik dengan pemerintah dan stakeholder guna membangun perikanan dan kelautan dalam aspek pengembangan produk-produk perikanan serta pemberdayaan masyarakat.

Menguasai konsep teoritis bidang pengetahuan dan keterampilan mengenai teknologi pengolahan hasil perikanan secara umum dan konsepteoritis secara khusus dalam bidang-bidang pengetahuan dan keterampilan tersebut secara mendalam.

1. Mengetahui, memahami, menerapkan dan mengembangkan iptek dibidang penanganan dan pengolahan hasil perikanan khususnya di lingkungan hutan tropis lembab;
2. Mampu mengidentifikasi dan menganalisis serta menyelesaikan permasalahan dibidang pengolahan hasil perikanan khususnya sumberdaya lokal;
   
3. Mampu menyebarluaskan dan melakukan pemberdayaan masyarakat dibidang pengolahan hasil perikanan dengan mengoptimalkan sumberdaya lokal untuk meningkatkan keterampilan dan kreativitas serta pendapatan masyarakat;
4. Mampu mengevaluasi dan mengimplementasikan iptek bidang pengolahan hasil perikanan pada sektor industri/bisnis.

1. Mampu mengelola sumberdaya perikanan dan kelautan khususnya di lingkungan hutan tropis lembab;
2. Memahami dan menguasai dasar-dasar budidaya perairan serta perikanan tangkap;
   
3. Memahami komoditas perikanan yang berpeluang menjadi produk bernilai jual tinggi;
4. Mampu berkomunikasi dan bekerjasama dengan pihak lain, sehingga dapat mengembangkan dan menerapkan ilmu pengetahuan teknologi hasil perikanan.

1. Mempunyai kinerja yang baik, berjiwa leadership, dan technopreneur.
2. Mempunyai kemampuan dalam sistem informasi dan teknologi.
   
3. Mempunyai kemampuan untuk bekerja secara individu maupun kelompok.
4. Mempunyai kemampuan untuk bekerja secara multitasking.